Bastion 365 is geïntegreerd met Microsoft 365. Dit vindt plaats via de Microsoft Graph API en optioneel de Microsoft Azure Storage. Voor de integratie is het eenmalig nodig dat de M365 administrator/beheerder van de klant Bastion 365 de benodigde rechten geeft via een Microsoft Admin consent. Dit gebeurt via een knop op de Bastion 365 Portal.